Σκοπός του Εργαστηρίου είναι η δημιουργία μιας σημαντικής συλλογής και βάσης δεδομένων για τα ελληνικά χειρόγραφα της βυζαντινής και μετα-βυζαντινής περιόδου. Τελικός στόχος είναι η ενδελεχής μελέτη της ιστορίας των κειμένων της αρχαίας ελληνικής και βυζαντινής γραμματείας. Η συλλογή, που αριθμεί πάνω από 500 ψηφιοποιημένα χειρόγραφα βυζαντινών και μετα-βυζαντινών χειρογράφων και καταλόγων χειρογράφων, και συνεχώς εμπλουτίζεται, στη μορφή μικροταινιών και ψηφιακών αρχείων. Από τον Σεπτέμβριο 2003, με χρηματοδότηση από το Περιφερειακό Επιχειρησιακό Πρόγραμμα Ανάπτυξης Κρήτης (2000-2006), απέκτησε σύγχρονα μηχανήματα ψηφιοποίησης μικροταινιών και μέχρι το 2013 ολοκληρώθηκε η διαδικασία ψηφιοποίησης του υλικού. Διαθέτει επίσης αναγνωστικά μηχανήματα και ηλεκτρονικούς υπολογιστές για την ανάγνωση επιτόπου των μικροταινιών και των ψηφιοποιημένων χειρογράφων. Έχει και μια μικρή βιβλιοθήκη παλαιογραφικού ενδιαφέροντος, τα βιβλία της οποίας εμφανίζονται με ειδική σήμανση στον κατάλογο της Βιβλιοθήκης του Πανεπιστημίου Κρήτης. Το 2016 έλαβε χρηματοδότηση από την Περιφέρεια Κρήτης για το πρόγραμμα Μελέτη και Έρευνα βυζαντινών χειρογράφων.
Το υλικό του Εργαστηρίου διατίθεται, αποκλειστικά για τους σκοπούς προσωπικής έρευνας, επί τόπου ή κατόπιν συμπλήρωσης του εντύπου αίτησης. Το Εργαστήριο, ύστερα από συνεννόηση με τον υπεύθυνο και με συμβολική αμοιβή, μπορεί να αναλάβει την ψηφιοποίηση υλικού για λογαριασμό τρίτων. Το Εργαστήριο προορίζεται για την κάλυψη των διδακτικών, σε προπτυχιακό και μεταπτυχιακό επίπεδο, και ερευνητικών αναγκών του Τμήματος Φιλολογίας, αλλά και άλλων Τμημάτων του Πανεπιστημίου, σε θέματα που εμπίπτουν στο αντικείμενό του.